Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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