Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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