Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms