Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDC16Q13042 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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