Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK2Q13002 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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