Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXF2Q12947 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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