Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFRD2Q12894 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms