Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TWF1Q12792 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TWF1Q12792 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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