Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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FOXO1Q12778 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXO1Q12778 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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