Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAPQ12770 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAPQ12770 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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