Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EP300Q09472 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EP300Q09472 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EP300Q09472 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EP300Q09472 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EP300Q09472 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms