Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C2orf54Q08AI8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms