Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCN1BQ07699 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms