Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms