Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCZQ05513 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms