Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP7AQ04656 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms