Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms