Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN2Q02246 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN2Q02246 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms