Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F1Q01094 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms