Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms