Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms