Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms