Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMF1P82094 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMF1P82094 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMF1P82094 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMF1P82094 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMF1P82094 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms