Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPCS3P61009 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPCS3P61009 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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