Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF4A1P60842 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.2 ms