Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms