Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTXN1P60606 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms