Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCCD1P59942 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms