Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms