Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3BP58499 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM3BP58499 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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