Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP4P57796 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP4P57796 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP4P57796 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP4P57796 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP4P57796 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms