Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY3P57055 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms