Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BACE1P56817 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BACE1P56817 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BACE1P56817 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BACE1P56817 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms