Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AFDNP55196 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AFDNP55196 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AFDNP55196 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms