Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP1B3P54709 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms