Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms