Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP4P49662 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP4P49662 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms