Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPFP49454 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPFP49454 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPFP49454 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPFP49454 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms