Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK8P49336 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK8P49336 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK8P49336 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms