Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms