Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA4P43694 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms