Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD52P43351 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD52P43351 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD52P43351 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD52P43351 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD52P43351 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms