Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRCA1P38398 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms