Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2IP36954 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2IP36954 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms