Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BMI1P35226 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BMI1P35226 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BMI1P35226 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BMI1P35226 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms