Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2H1P32780 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms