Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRS3P32247 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRS3P32247 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms