Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC12P31275 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms