Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms