Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND3P30281 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND3P30281 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND3P30281 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND3P30281 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms